Molekulare Kardiologie · AG Eden / FreyKlinik für Innere Medizin III · Kardiologie, Angiologie und Pneumologie
AG Eden / Frey

Methoden & Technologien

Unsere Arbeitsgruppe verfügt über ein breites Spektrum an Methoden und Technologien für die kardiovaskuläre Grundlagenforschung.

Methodenspektrum

Vom Gen zum Organismus.

Unsere Methoden decken jede Ebene ab, auf der kardiale Signalwege untersucht werden: von der Sequenzierung von Kandidatengenen bis zur Phänotypisierung transgener Mausmodelle.

5 Methodenfelder · 16 Verfahren

  1. 01 · GenGenomik & Molekularbiologie
  2. 02 · ProteinProteomik & Interaktomik
  3. 03 · ZelleZellkultur & Modellsysteme
  4. 04 · StrukturBildgebung & Mikroskopie
  5. 05 · OrganismusIn-vivo-Phänotypisierung
01 · Gen

Genomik & Molekularbiologie

Kandidatengene für Kardiomyopathien sequenzieren, Transkriptome erfassen, Konstrukte klonieren und Gene über adenovirale oder AAV-Vektoren übertragen.

  1. Gensequenzierung zur Identifizierung von Kardiomyopathie-Kandidatengenen
  2. RNA-Sequenzierung (RNA-Seq)
  3. Advanced Cloning (Gateway-Klonierungssystem)
  4. Adenoviraler Gentransfer
  5. AAV-basierter Gentransfer
KI-generierte Illustration: DNA-Doppelhelix, darunter virale Vektoren, die per Endozytose von einer Zelle aufgenommen werdenDNASEQUENZIERUNGRNA-SEQViraler VektorENDOZYTOSEKI-generierte Illustration
02 · Protein

Proteomik & Interaktomik

Proteom und Phosphoproteom kardialer Signalwege erfassen und Proteininteraktionen in situ nachweisen.

  1. Proteomics
  2. Phosphoproteomics
  3. Proximity Ligation Assay (PLA)
KI-generierte Illustration: Signalproteine mit Phosphatgruppen; zwei benachbarte Proteine, über Antikörper und einen DNA-Ring zu einem leuchtenden PLA-Signal verbundenPLA-SignalANTIKÖRPERPHOSPHATKI-generierte Illustration
03 · Zelle

Zellkultur & Modellsysteme

Primäre Kardiomyozyten neonataler und adulter Ratten sowie iPS-Zellen.

  1. Neonatale Rattenkardiomyozyten (NRVCM)
  2. Adulte Rattenkardiomyozyten (ARVCM)
  3. Induzierte pluripotente Stammzellen (iPS-Zellen)
KI-generierte Illustration: Kulturschale mit stäbchenförmigen adulten und flachen neonatalen Kardiomyozyten sowie einer iPS-ZellkolonieARVCMiPS-KolonieNRVCMKI-generierte Illustration
04 · Struktur

Bildgebung & Mikroskopie

Proteine und Membranstrukturen in der Herzmuskelzelle lokalisieren.

  1. Konfokale Lasermikroskopie

Immunfluoreszenz STRIP1 und Nucleolin. AG Eden / Frey. T-Tubulus-Netzwerk eines Kardiomyozyten, ANEPPS-Membranfärbung, 40×. Ausschnitt einer Zelle, um 90° gedreht; Original rot, hier in monotoner Cyan-LUT. AG Eden / Frey.

Immunfluoreszenzaufnahme mit STRIP1 und NucleolinImmunfluoreszenz
T-Tubulus-Netzwerk eines Kardiomyozyten, ANEPPS-Membranfärbung, 40-fach, AusschnittANEPPS · 40×
05 · Organismus

In-vivo-Phänotypisierung

Transgene Mausmodelle, phänotypisiert über Morphometrie, Echokardiographie und invasive Hämodynamik.

  1. Transgene Mausmodelle
  2. Morphometrie
  3. Echokardiographie
  4. Invasive Hämodynamik
KI-generierte Illustration: transluzentes Mausherz im Anschnitt, ein Katheter liegt über die Aorta im linken VentrikelKatheterINVASIVEHÄMODYNAMIKLINKERVENTRIKELKI-generierte Illustration

Mit uns forschen.

Wir suchen Doktorandinnen und Doktoranden, Postdocs und Partner, die diese Methoden mit uns einsetzen und weiterentwickeln.